发起众筹
意见反馈
有什么不好用的地方,请告诉我们,我们会努力做的更好!
您的联系方式,电话/qq/邮箱(选填)

请输入意见反馈内容!

发送私信

收件人:暁

你想向TA说些什么呢~(最多300字)

iGEM2017 BGIC-UNION团队——试纸上的肺癌检测

发起人 联系我
1

128支持数

¥8,250已筹款

28%

已失败 目标筹资¥30,000
  • 项目详情
  • 项目更新(0
  • 评论(42
  • 支持记录(128

从合成生物学开始的iGEM

不仅是对科学家,对所有人类而言,合成生物学都像是打开了新世界的大门。这一学科既不局限于化学也不拘泥于现有的生物,用基因工程来构造数不尽的神奇产品。

而iGEM,国际遗传工程机器大赛,便是在合成生物学的成长中应运而生的。

这是由麻省理工学院2003年创办,2005年发展为国际性学术竞赛,合成生物学领域最高国际性学术竞赛。涉及生物学、计算机科学、数学等多学科,是以合成生物学为核心多学科交叉国际级科技竞赛,其理念在于鼓励大学生积极创新,用创新去改变世界 。具有多学科背景的iGEM团队需要利用标准生物模块(Biobricks)来构建基因回路、建立有效的数学模型,实现对精致复杂人工生物系统(artificial biosystem)的预测、操纵和测量以完成比赛。[

每年大赛参赛队伍的相关研究成果都受到如:《科学》、《自然》、《科学美国人》、《经济学人》 等期刊学术界和工业界的广泛关注,同时受到BBC等传统媒体的关注和专题报道。

iGEM2017 BGIC-UNION团队——试纸上的肺癌检测 (中学生,基因工程,癌症)

课题背景——目标EML4-ALK

肺癌是发病率和死亡率增长最快,对人群健康和生命威胁最大的恶性肿瘤之一。近50年来许多国家都报道肺癌的发病率和死亡率均明显增高,男性肺癌发病率和死亡率均占所有恶性肿瘤的第一位,女性发病率占第二位,死亡率占第二位。

而对肿瘤的检测,如今的金标准仍是组织活检。且说穿刺给人带来的巨大痛苦让不少人望而却步,一些恶性肿瘤的异质性(恶性肿瘤细胞有时会分裂出良性的非至瘤亚群)也会干扰到确诊,大幅降低了活检的准确性。

近年来,血液活检逐渐为世人所知。之前的方法大多着重于观测肿瘤细胞本身,而血液活检则是瞄准了血液里的DNA碎片。血液活检中只要检测肿瘤细胞一些特有的DNA就可以在发病早期判断其行径。

肿瘤患者的血液中存在痕量的ctDNA(circulating tumor DNA),它们由肿瘤细胞的坏死,吞噬作用或分泌而流入患者的血液。因为肿瘤细胞是正常细胞突变形成的,所以检测ctDNA可以检测到细胞的特异性突变。因为ctDNA有肿瘤细胞的遗传信息,所以不同肿瘤的ctDNA是不一样的,包括其在血液中的含量。

化疗和手术对ctDNA含量也是会有影响的,研究发现,手术两小时后ctDNA就会逐渐消失;而血液中ctDNA浓度高的病人两年内生存率也会偏低。所以检测ctDNA不仅可以检测肿瘤的突变还可以检测用药和手术效果。

因此,对于一种癌症,只要找到特有的基因位点,血液活检便成为了可能,包括肺癌。

在08年,科学家已在非小细胞肺癌中发现了变异的基因导致蛋白EML4与ALK出现错误的结构,实验通过两名患者也表明了错误的蛋白与非小细胞肺癌的直接联系。(1)同时,逆转录PCR提供的证据也表明了EML4-ALK与肺癌之间强有力的关系。(2)由此,检测这一融合基因便是检测非小细胞肺癌的关键。

iGEM2017 BGIC-UNION团队——试纸上的肺癌检测 (中学生,基因工程,癌症)

课题介绍——我们的想法

我们要检测目的基因EML4-ALK的方法,改进了2015北大igem团队的,名为paired-dCas9 system的设计。(3)这个方法需要sgRNA 、dCas9,和荧光素酶来构成检测系统。荧光素酶被我们分成两半,分别连接一个dCas9蛋白,而蛋白上则携带我们设计好的任意一种单链向导RNA——与EML4-ALK上游一小段互补,或是下游。这样只要目标序列存在,两种RNA携带的蛋白便都可以紧密地结合在序列上,此时,两半荧光素酶合二为一成为完整的,具有功能的荧光素酶,催化荧光物质产生,我们也得以用肉眼观测结果。

上述的蛋白与核酸,我们都将用基因工程的方法得到。sgRNA由对应的DNA扩增并体外转录,dCas9与两半荧光素酶的蛋白则是由对应的DNA构建成重组质粒,转入大肠杆菌表达、提取。

iGEM2017 BGIC-UNION团队——试纸上的肺癌检测 (中学生,基因工程,癌症)

课题延伸——下一步,基因试纸

对于肺癌基因的检测,我们不仅要合成新的检测系统,而且还计划着将其设计成可以真正应用的产品。

由于蛋白质不易保存,但冻干后就变得难以破坏,也就是易于保存、运输。而基因试纸的原理正是将DNA、蛋白等反应所需的物质冻干在一张试纸上,令待检测的液体本身提供反应所需的环境,从而降低了产品的成本。如果将我们的检测系统也做成基因试纸,那么肺癌基因位点EML4-ALK的检测只需要将待测的血液滴在试纸上而后通过荧光来判断结果。不但省去了繁琐的操作,而且在缺乏先进设备的地区也同样能够完成检测。

主要参考文献

1.Young Lim Choi,Kengo Takeuchi, et al.“Identification of Novel Isoforms of the EML4-ALK Transforming Gene in Non–Small Cell Lung Cancer”Cancer Res 2008;68:4971-4976.

2.Kengo Takeuchi,Young Lim Choi, et al.“Multiplex ReverseTranscription-PCRScreeningfor EML4-ALK FusionTranscripts ”Clinical Cancer Research ·November 2008

3.Yihao Zhang, Long Qian, et al.”Paired Design of dCas9 as a Systematic Platform for the Detection of Featured Nucleic Acid Sequences in Pathogenic Strains “ ACS Synthetic Biology. August 2016

iGEM2017 BGIC-UNION团队——试纸上的肺癌检测 (中学生,基因工程,癌症)

团队介绍——BGIC-UNION

从队名来看,就能知道这个队伍不属于任何一个高中。

队员里的海外党来自英、美、加拿大,国内党也遍布大江南北。

这是一个神奇的团队:有生物学基础扎实的学霸博览文献,寻找最为可行的方案来撑起整个项目的理论基础;有心灵手巧的宣传组员各显神通,从线上线下将项目与外界紧密相连;当然最少不了将宝贵的课余献给实验室的同学们,没有他们日复一日推动实验,再神奇的设想也终要停在理论……(以上三类人员不乏交集)

我们的队伍创建于三月份,然而因为学业缘故队员们并没有太多聚在一起的时间。我们每周会举行例会并分配任务,以此确保项目顺利进行。在七,八月份,我们会趁着暑假好好干活,认真完成项目,并在九,十月份收尾,进一步宣传,探索我们癌症基因检测方法的应用价值。

在十一月份,我们将飞往美国参加Giant Jamboree,展示自己的project,也从世界各地的优秀参赛学生身上学习。在iGEM的活动中,我们除了学习学科理论知识,获得实践操作经验外,还学会了很多,比如如何团队合作、宣传项目、美工设计、联系专家,进行众筹和搜查信息。虽然我们分成了三个组,但不少组员积极地在各方面贡献自己的主意,无形中也分享,收货了更多。

我们凭着兴趣和热爱聚集在一起,希望在这不凡的经历中,可以让更多中学生参与到思考,实践与创造的过程,赢得属于他们的美好未来。

iGEM2017 BGIC-UNION团队——试纸上的肺癌检测 (中学生,基因工程,癌症) iGEM2017 BGIC-UNION团队——试纸上的肺癌检测 (中学生,基因工程,癌症) iGEM2017 BGIC-UNION团队——试纸上的肺癌检测 (中学生,基因工程,癌症)

课题进展

从三月份组队开始已经经历了五个月,虽然实验室里大大小小的失误令我们的进度略微落后于计划,但同学们终归是在错误中不断成长着,如今的实验操作日渐娴熟,进展当然也是愈发顺利。

迄今为止,我们自己的项目中分别构建了可表达7种sgRNA的生物转并在菌落PCR之后进行了体外转录,纯化后电泳结果显示正确,而且可以表达相应的sgRNA;同时还有两种sgRNA和一种蛋白的重组质粒在构建后也得到了正确的测序结果;而我们设计中两半连接dCas9的荧光素酶也由构建的生物砖成功表达。

(下面第一张图是sgRNA中三个33a样本生物砖的酶切,其中200~400bp间的条带显示了正确的目的基因大小,而剩余较大的条带为质粒骨架;第二张图为7种sgRNA真正进行体外转录后的提取结果)

实验室的下一步是继续完成剩余生物砖的构建,检验是否有相应的功能。如果表达成功,便可以提取所有设计中的RNA与蛋白,在合适的体系中组装,最终得到设计中的完整系统。而后,就可以用预定的EML4-ALK序列检验这个系统是不是真的有用了。

iGEM2017 BGIC-UNION团队——试纸上的肺癌检测 (中学生,基因工程,癌症) iGEM2017 BGIC-UNION团队——试纸上的肺癌检测 (中学生,基因工程,癌症)

交流宣传

实验室之外,我们也有多次外出进行交流。

7月中旬拜访深圳市华大基因华大智造的魏汉敏老师,学习了癌症靶向产品相关的知识,在试纸设计得到了意见与建议,学到了如何将技术转化成产品;

7月29日赴广州会见华南理工大学SCUT-China_B队伍,在相互对项目进行过探讨后吸取了对方的不同看法,进一步认识到自己的不足;

8月15日参加位于北京大学深圳医院的肿瘤相关的讲座,深入了解现今控制癌症的手段与效果以及不同疗法的优劣所在,对我们项目的背景有了更充分的认知。

iGEM2017 BGIC-UNION团队——试纸上的肺癌检测 (中学生,基因工程,癌症) iGEM2017 BGIC-UNION团队——试纸上的肺癌检测 (中学生,基因工程,癌症) iGEM2017 BGIC-UNION团队——试纸上的肺癌检测 (中学生,基因工程,癌症) iGEM2017 BGIC-UNION团队——试纸上的肺癌检测 (中学生,基因工程,癌症)

计划一览——八个月和一万两千八百公里

2017年3月-11月,从深圳,到波士顿,and hopefully,全世界。

 时 间 阶段目标

2017年3-4月 队伍组建,分工/敲定项目

2017年5月 开启众筹计划/生物砖设计

2017年6月 与相关组织,机构进行交流

2017年7月 进行下一轮优化,视频拍摄,网页制作

2017年8月 体内试验,开展实践活动

2017年9月 演讲展示

2017年10月 准备giant jamboree演讲展示

项目经费总额 17万元

其中 先期投入 10万元

后期投入 7万元

支出科目/金额(万元)/ 备注

1、科研业务费 / 2 /科研业务费包括实验中所得到的技术支持等费用

2、实验材料费/ 5 /实验原材料包括购买质粒等实验中所需要的所有原材料

3、仪器设备费/ 3 /仪器设备费包括购买以及使用实验中所需的仪器设备的费用

5、实践活动费/ 7 /实践活动费包括项目周边制作,活动举办资金,外出参赛等活动费用

〒▽〒实在是很多呢

iGEM2017 BGIC-UNION团队——试纸上的肺癌检测 (中学生,基因工程,癌症) iGEM2017 BGIC-UNION团队——试纸上的肺癌检测 (中学生,基因工程,癌症) iGEM2017 BGIC-UNION团队——试纸上的肺癌检测 (中学生,基因工程,癌症)

关于众筹——您的每一分支持我们都将感激不尽

改良肺癌检测的项目虽然听起来很厉害,大家也从组队起就脚踏实地地投入各种工作,但基因工程的实验与iGEM参赛的费用实际上相当昂贵(参照上一节)。对于还是中学生的我们来说,这也是不容忽视的。

在此次众筹之前,我们还发起过分别针对国内外的两次众筹——第一次国内众筹定的九千元“小目标”在一夜之内就已达成,却远不足以覆盖所需的经费,第二次在IGG网站发起针对海外的众筹目前集资210USD。

无论是物质上还是精神上,您的微小投资将给予莫大的帮助。

我们的经费将用于:基因片段合成、仪器与试剂费用、质粒测序、队服、iGEM报名费等。

我们将珍视您的信任与支持,希望能在您的鼓励下为癌症检测尽到绵薄之力,将新的检测系统带去iGEM的大会,也带给这个日新月异的世界。

iGEM2017 BGIC-UNION团队——试纸上的肺癌检测 (中学生,基因工程,癌症) iGEM2017 BGIC-UNION团队——试纸上的肺癌检测 (中学生,基因工程,癌症)

支持记录

订单序号 支持者 支持项 数量(128) 支持时间

¥8,250

已筹款

128

支持数

已失败

项目状态

立即支持
风险说明
  1. 众筹不是商品交易。支持者根据自己的判断选择、支持众筹项目,与发起人共同实现梦想并获得发起人承诺的回报,众 筹存在一定风险。
  2. 众筹网平台只提供平台网络空间、技术服务和支持等中介服务。作为居间方,并不是发起人或支持者中的任何一方,众 筹仅存在于发起人和支持者之间,使用众筹平台产生的法律后果由发起人与支持者自行承担。
  3. 众筹项目的回报发放、发票开具及其他后续服务事项均由发起人负责。如果发生发起人无法发放回报、延迟发放回报、 不提供回报后续服务等情形,您需要直接和发起人协商解决,众筹网对此不承担任何责任。
  4. 由于发起人能力和经验不足、市场风险、法律风险等各种因素,众筹可能失败。众筹期限内未达到目标筹资额失败的项 目,您支持的款项会全部原路退还给您;其他情况下,您需要直接和发起人协商解决,众筹网对此不承担任何责任。
  5. 支持纯抽奖档位、无私支持档位,一旦支付成功将不予退款,众筹失败的除外。

抽奖规则

查看我的抽奖号
  • 获得抽奖号

    购买抽奖回报项时按购买顺序产生抽奖号。

  • 开奖日期

    项目成功结束后的下一个周一开奖。如遇周一为非工作日,则延至周一后的第一个工作日开奖。

  • 中奖号计算方法:

    *开奖日收盘时的上证指数6位数字 & 收盘时的深证成指7位数字,两组数字排列得到的13位数;

    *将此13位数整除以项目结束时总抽奖号个数,得到的余数加1。即得到该项目的中奖号码。

    *如果项目开多个奖,则以项目公示“ 每X个参与者抽取1名中奖用户”中的X作为基数,第N个中奖号 码=第一个中奖号码+(N-1)*X

    *如果加值后抽奖号码超过了总抽奖号个数,则将抽奖号码减去抽奖号个数得到新的中奖号码。

    *每个抽奖号只有一次中奖机会,如果抽奖号重复中奖,则将该抽奖号码+1得到新的中奖号码。

    *如遇周末节假日等股市休市情况,收盘指数以上一个交易日数据为准。

  • 例:

    某项目的抽奖规则为每500个参与者抽取1名中奖用户,项目成功结束时共发放4597个抽奖号。
    2015-07-30收盘时的上证指数是 2927.08,
    2015-07-30收盘时的深证成指是 12926.61,
    将这两组数字排列得到的13位数为 2927081292661,
    以2927081292661整除以4597,商为636737283,余数为2710,
    用2710+1=2711,第一个中奖号即为2711;第二个中奖号 2711+(2-1)*500=3211;第三个中奖号 2711+(3-1)*500=3711......

热门推荐
我们想在中国的大地上…

已筹资:¥26,520(107%)

剩余时间:12天

支持非遗科普木工绘本…

已筹资:¥10,199(102%)

剩余时间:17天

认养一棵同心桃,参与…

已筹资:¥15,327(192%)

剩余时间:19天

我是《黑象》作者,这…

已筹资:¥28,377(142%)

剩余时间:15天

将此项目分享给微信朋友或分享到朋友圈,让更多的朋友看到,为梦想接力。

微信扫描二维码加入我们

新手红包

每人限领一次

输入手机号领取
图文验证码

2

新手红包

已存入13661047的账户

提交

©2015 北京网信众筹网络科技有限公司 zhongchou.com 版权所有 京ICP证150145号 | 出版物经营许可证编号新出发(京)批字第直140141号 | 食品流通许可证 编号:SP1101051410311599 | 京公网安备11010502026064